S'estimant trahi par l'OSS, le plus célèbre des Spy Kids, Juni Cortez, a demissionné. Pourtant, lorsque le garçon apprend que sa soeur, Carmen, est en danger, il n'hésite pas à courir à son secours. Pour avoir tenté de percer le diabolique secret d'un jeu vidéo qui capture l'esprit de ceux qui perdent, la jeune fille est restée prisonnière. Ce jeu-événement, le bien nommé Game Over, sera mis en vente dans quelques heures... Mettez vos lunettes 3D et retrouvez Juni et Carmen Cortez, les deux héros de Spy Kids, pris au piège du jeu Game Over ! Cramponnez-vous, ça va décoiffer !